Production I.G制作在漫画、小说等多个媒体上展开的系列，这个是OVA。某日，一个巨大陨石掉落到了日本富士山附近。人类在陨石内部发现了外星技术并设立了专门的机构对其进行解析。10年后的某日，外星人ワーキュリー到地球抢夺陨石，而同时人渣教师羽柴当吉也在打陨石的主意，并强迫他的八个学生去启动陨石内部的仪器，结果超级机器人ガクセイバー就由陨石中诞生了……ガクセイバー由脑波操纵，武器则都靠驾驶员自己的想象力来生成。在漫画版中机体的颜色是蓝，但由于OVA的主战场是宇宙，为了能和背景对比而改成了红色。
在神秘委托者的招待下，小五郎与柯南一行人来到了横滨。一行人受邀来到一座巨大城堡，没想到却掉入黑影的神秘男子所设下的陷阱。小兰、灰原与少年侦探团，也因此落入敌人手中成为人质。时间限制为12个小时，如果不在时间内解开男子所出的谜题，小兰他们身上的炸弹就会爆炸。 r “你能了解失去心爱的人，是什么样的心情吗？工藤” r 这名男子居然知道柯南其实就是工藤新一？！这名男子的真正身份，难道是…… r 就在同时，“关西的高中生侦探”服部平次的儿时玩伴和叶也被抓走（因为手上有炸弹而受到威胁，并非抓走）成为了人质
